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復(fù)旦大學(xué)等創(chuàng)建精準N糖蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

日期:2025-05-05 02:55
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摘要: 復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系教授楊芃原團隊、中科院計算技術(shù)研究所研究員賀思敏團隊、蛋白質(zhì)科學(xué)中心(上海)研究員黃超蘭團隊合作研究,創(chuàng)建了基于質(zhì)譜的通量糖基化肽段分析方法pGlyco2.0,為精準N糖蛋白質(zhì)組學(xué)了新技術(shù)。今天,相關(guān)研究成果以《pGlyco2.0:基于綜合質(zhì)控和步質(zhì)譜法的精準N糖蛋白質(zhì)組學(xué)糖肽分析方法》為題發(fā)表于《自然·通訊》。 據(jù)悉,楊芃原、賀思敏和黃超蘭為共同通訊作者。楊芃原為該文的Lead Contact。 糖基化是復(fù)雜的蛋白后修飾之。與其他蛋白后修飾相比...


復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系教授楊芃原團隊、中科院計算技術(shù)研究所研究員賀思敏團隊、蛋白質(zhì)科學(xué)中心(上海)研究員黃超蘭團隊合作研究,創(chuàng)建了基于質(zhì)譜的通量糖基化肽段分析方法pGlyco2.0,為精準N糖蛋白質(zhì)組學(xué)了新技術(shù)。今天,相關(guān)研究成果以《pGlyco2.0:基于綜合質(zhì)控和步質(zhì)譜法的精準N糖蛋白質(zhì)組學(xué)糖肽分析方法》為題發(fā)表于《自然·通訊》。

據(jù)悉,楊芃原、賀思敏和黃超蘭為共同通訊作者。楊芃原為該文的Lead Contact。

糖基化是復(fù)雜的蛋白后修飾之。與其他蛋白后修飾相比,糖基化不但會產(chǎn)生宏觀不均性(每個蛋白上可能有多個后修飾位點),更會產(chǎn)生海量的微觀不均性(每個位點上可能有幾十甚至上百種不同的后修飾基團)。此外,糖鏈本身的離子化效率很低。這些因素的結(jié)合使得糖基化分析的通量和質(zhì)量遠低于蛋白質(zhì)組學(xué)的常規(guī)分析水平。

這項研究通過深入研究和測試質(zhì)譜條件,開發(fā)基于階梯能量的步質(zhì)譜采集法,提了糖肽鑒定的通量和開發(fā)具有自主產(chǎn)權(quán)的pGlyco2.0糖肽檢索引擎,從糖鏈、肽段、糖肽三個層面對糖肽數(shù)據(jù)庫檢索進行質(zhì)控,從而大幅提升了N糖蛋白質(zhì)組學(xué)分析的通量和質(zhì)量。

同時,研究人員次將重標元素應(yīng)用于糖肽鑒定準確度分析,為該域的質(zhì)控分析了新的方法及標準。

專表示,這項研究報道了目前大的糖基化數(shù)據(jù)集:在1%的假陽性率下,在小鼠的五個臟器種鑒定到了超過萬條N糖肽。

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